赛里木湖湖水淡化的原因主要是：湖西北部水域距离湖西最大的河沟查干果勒较近，低矿化的高山雪水进湖区稀释所致。2010年以来，由于暖湿气候的影响，入湖水量增多，矿化度及主要离子有减小趋势（HCO除外），碳酸盐含量增加指示了湖泊水体淡化，湖泊处于逆向演化阶段。
