鉴别培养基（differential medium） 用于鉴别不同类型微生物的培养基。在培养基中加入某种特殊的化学物质，某种微生物在培养基中生长后能产生某种代谢产物，而这种代谢产物可以与培养基中的特殊化学物质发生特定的化学反应，产生明显的特征性变化，根据这种特征性变化，可将该种微生物与其他微生物区分开来。
鉴别微生物营养特点的，经常是基因突变菌缺少某个酶，从而无法在普通营养的培养基上生长，得加特别的营养物才可生长。通过丝绒印章，对应的地方对比出某种菌，从而达到鉴别。如基因工程中常用的蓝白斑实验。
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