广州经济技术开发区国家税务局在2005年6月被国家税务总局在核定和规范全国基层税务机构设置中核批为广州市副局级单位。广州经济技术开发区国家税务局（广州保税区国家税务局）与广州市萝岗区国家税务局实行三块牌子、一套人马，合署办公。
