医院重视对外交流。1999年开始接受外国留学生实习。与国内大学、大型医院及美、日、英、德、奥等十几个国家建立友好院际合作关系。医院同时也是第二临床医学院,承担第二临床学院的临床教学任务,拥有临床医学一级学科硕士点15个。每年接受来自全国各地高等医学院校的本、专科实习人员。2006年1月温州医学院获得了博士点授予权,其中眼科、外科、妇产科成为博士点。医院现有高级职称347人,博士31人,硕士388人,博士研究生导师5人,硕士研究生导师86人。