该负责人从公司拿的钱，属于对公司的欠款。正常情况下，该负责人应该按期归还该借款，或者使用办理业务的发票抵消该借款。由于该负责人没有偿还借款或者用发票去抵消借款，这种情况下，财务人员可以从该人员的薪酬里扣除该借款。至于计税问题，该笔借款并不会影响其所得税的计算，扣除欠款也应该是在计算所得税之后，在扣除该笔借款的。
