蚜虫：4～9月发生，为害嫩梢、嫩叶，严重时引起落花落果。防治方法：用40%乐果乳油1000倍液或2.5%鱼藤精500倍液或1∶1∶10的烟草石灰水防治。
桃蛀螟：以幼虫蛀食果实，严重影响木瓜的产量和质量。防治方法：冬季清理林地，收集虫果烧毁或深埋；玉米、向日葵等作物是桃蛀螟的主要寄主植物，在木瓜园周围不宜种植，以减少虫源；幼虫初孵期用2.5%敌杀死3000倍液喷雾。
天牛：幼虫蛀食树干。防治方法：把细钢丝伸入蛀孔，将虫钩出杀死；或用棉球蘸敌敌畏乳油塞入虫孔，并涂泥封孔熏杀。
星天牛：以幼虫蛀食木瓜树干、枝条，容易造成风折树枝，树势减弱。防治方法：人工捕杀成虫；用棉花蘸80%敌敌畏乳油塞入虫孔，用黄泥堵住虫孔毒杀幼虫。
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