超声内镜检查根据不同地区、不同医院，费用略有差异。超声内镜与小肠镜、胶囊内镜相同，均未被纳入医保范围，属于自费项目。北京三级甲等医院，小探头超声内镜费用大概为800元左右，再加上化验检查、病理等，费用大概为1000元左右。如果进行大探头超声内镜，可以检查胰腺病变或者其他病变，并通过超声内镜引导下穿刺，费用会更高一些。
