A、①～⑥表示物种形成过程中变异是不定向，包括基因突变、基因重组和染色体变异，A错误；B、品系1和品系2种群基因库出现了较大差异不代表新物种的形成，只有当品系1和品系2出现生殖隔离时，才会形成两个新物种，B错误；C、t4时，种群的数量增殖速率最快，若乙种群为某种害虫，则应在t4时之前进行防治，C错误；D、t3～t5时间内，甲种群数量的增长率为0，属于稳定型，而乙种群数量增长率大于0，属于增长型，D正确．故选：D．
