A、加热杀死的S型菌的DNA进入R型菌细胞内，仍能作为转化因子，使R型菌转化成S型菌，A正确；
B、R型菌转化后出现荚膜，发生了性状改变，反对者认为可能是突变所致，不能说明DNA是遗传物质，B正确；
C、艾弗里提取的DNA掺杂有非常少量的蛋白质，实验中没有完全排除蛋白质的作用，所以科学家又用噬菌体侵染细菌实验进一步证明，C正确；
D、艾弗里无法使DNA与蛋白质完全分开，故无法证明DNA肯定是遗传物质，但没有证明DNA是主要的遗传物质，D错误．
故选D．
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