根本原因在于各种微生物的基因不同，直接原因是各种微生物的表现形状不同。有些微生物必须在氧气充足的环境下才能正常地进行生长繁殖，如好氧细菌醋酸菌；有些细菌却需要无氧的条件，如厌氧细菌乳酸菌。有些微生物适宜在酸性条件下生长繁殖，如霉菌；而细菌却需要中性或弱碱性的生存环境不同的微生物对青霉素的敏感程度也不同。如培养酵母菌和霉菌时在培养基中加入青霉素就可有效抑制细菌的生长繁殖在培养乳酸杆菌时需要在培养基中加入维生素除上面陈述之外还有很多事例。总之，培养不同的微生物，除了需要满足培养基的基础组分外，还需要满足其生长对PH、特殊营养物质以及氧气等诸多特殊要求，才能得到品质尽可能高的菌种
在配制培养基时，要加入牛肉汁等有机物，是因为细菌和真菌没有叶绿体，不能进行光合作用制造有机物，必须依靠现成的有机物生活，因此首先要配制含有营养物质的培养基，可以用牛肉汁加琼脂熬制．牛肉汁含有丰富的有机物，为细菌等生物的生活提供有机物．
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