从法律角度说,如果你父亲已经与单位签订书面协议,那么就认为是双方达成了一至,如果你们再去单位索赔法律上是不支持的.
人身伤害案件如果私了,万一对方加重病情,就算签有私了协议都是无效的,那个是重大误解合同,属于无效合同。去法院起诉就好了。
协议归协议,如果你家困难,已经无力支付医药费,法院酌情考虑;或者你家人能胡搅蛮缠,每天去法院一趟,起诉后法院也会酌情考虑。