A、种子的主要结构是胚，胚由①胚芽，②胚轴，③胚根，④子叶组成，胚由受精卵发育而成，正确．B、种子萌发必须自身条件和外界条件同时具备才能萌发，故错误．C、种子萌发时首先突破种皮的是③胚根，故错误．D、保护组织具有保护内部柔嫩部分的功能，⑤种皮和⑦果皮属于保护组织，故错误．故选：A
