（1）由以上分析可知：甲图中a表示地理隔离，c表示生殖隔离，b表示基因频率变化的不断积累．
（2）图甲中①～⑥表示生物变异，由图中箭头的方向可知变异的不定向性；
（3）原松鼠种群中AA的基因型频率为25%，Aa的基因型频率为50%，aa的基因型频率为25%．假设开始松鼠的种群数量为100只（AA为25只、Aa为50只、aa为25只），环境变化后，峡谷北侧山高林密，生活于其中的松鼠种群中显性个体即基因型为AA、Aa的个体数量在一年后各增加20%，隐性个体即基因型为aa的个体数量减少20%，则AA的数量为30只，Aa的数量为60只，aa的数量为20只，所以一年后a的基因频率=（60+20×2）÷（30×2+60×2+20×2）≈45.45%．aa基因型频率为45.45%×45.45%≈18.18%
故答案为：
（1）地理隔离 生殖隔离 种群基因频率的改变
（2）变异是不定向的
（3）45.45% 18.18%
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