已知红绿色盲是由X染色体上的隐性基因控制的,则这对表现型正常的夫妇可能的基因型是XBX-×XBY,由于这对夫妇生了一个血友病男孩,其致病基因肯定来自于母亲,所以母亲的基因型是XBXb.根据题意已知该男孩的性染色体为XXY,且患有色盲,则可以判断其两个X染色体上都是b,即基因型是XbXbY,而父亲没有b基因,所以该男孩的两个X染色体上的致病基因都来自母亲.故选:A.