旷工扣除当时工资，如果没有扣完，当然应该支付工资。
月工资、加班工资均可根据以下规定计算：
1、《国.务.院关于职工工作时间的规定》第3条。
2、《中华人民共和国劳动法》第44条。
3、《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》。
看《工资支付暂行规定》和《对〈工资支付暂行规定〉有关问题的补充规定》，上面对拖欠和克扣工资有明确的定义。拖欠或克扣劳动报酬或加班工资的，可以按《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第3条或《劳动合同法》第85条规定解决。不同的是前者可以直接主张，后者需要劳动部门责令后仍不支付才能主张。
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