不相同.叶绿体主要含少量DNA和RNA,还有大量的关于光合作用的酶.而线粒体除了含少量DNA和RNA外还有大量关于呼吸作用的酶.在叶绿体基质内进行的是光合作用的暗反应阶段,线粒体基质内主要是有氧呼吸第一阶段和无氧呼吸的全过程.