解:连接OE,OF,∵⊙O内切于△ABC,切点分别为D、E、F,AD=4,BD=6∴AE=4,BF=6,设圆的半径=R,∵△ABC是直角三角形,又∵⊙O内切于△ABC,切点分别为D、E、F,∴EC=CF=R,∴AC=4+R,BC=6+R,根据勾股定理得(R+4)2+(R+6)2=100,解得R=2或-12,负值舍去.∵阴影部分的面积=正方形OECF的面积-扇形的面积,∴阴影面积=2×2- 90π×4 360 =4-π.