婚姻机构没有档案,就说明你们不是合法的婚姻,不是合法的婚姻属于非法同居,非法同居的男女双方,一方申请法院解除非法同居,法院都会支持的,只是协调财产分割和子女抚养问题,具体你可以去法律援助机构找律师咨询一下。
可以直接向法院提起离婚